ATP荧光检测仪基于萤火虫发光原理，利用“荧光素酶—荧光素体系”快速检测三磷酸腺苷(ATP)。ATP拭子含有可以裂解细胞膜的试剂，能将细胞内ATP释放出来，与试剂中含有的特异性酶发生反应，产生光，再用荧光照度计检测发光值，微生物的数量与发光值成正比，由于所有生物活细胞中含有恒量的ATP，所以ATP含量可以清晰地表明样品中微生物与其他生物残余的多少，用于判断卫生状况。
标本采集后，ATP采样棒应浸泡在能将细胞内ATP释放出来的容剂中。而后细胞内部释放出的ATP、以及ATP采样棒从物体表面抹取的ATP再和*的液体试剂一起反应。检测的液体试剂含有两种萤火虫酶---荧光素和荧光素酶，虫荧光素和虫荧光素酶在ATP存在的条件下会发光。发出的光可由ATP荧光仪进行检测。检测的发光量与ATP的总量成正比。数值越高，表明ATP的量越多，也就意味着表面的残留物越多。
ATP荧光检测仪六个特性：
实用性 —— 可根据环境检测需求设定上下限值，做到数据快速评估预警，表面洁净度快速筛查。
灵敏度高 —— 10-15～10-18 mol
速度快 —— 常规培养法18-24h以上，而ATP只需要十几秒钟 .
可行性 —— 微生物数量与微生物体内所含ATP有明确的相关性。 通过检测ATP含量，可间接得出反应中微生物数量
可操作性 —— 传统培养方法需要在实验室由经过培训的技术人员进行操作；而ATP快速洁净度检测操作非常简便，只需简单的培训即可由一般工作人员进行现场操作。
体验更好 —— 试子套管采用插拔式灵活设计，可定期清洗长期使用，延长仪器寿命。
