ATP荧光检测仪在食品行业的应用非常广泛，可以用于食品表面微生物检测、手卫生检测、餐饮器具洁净度检测、食品加工器具、工作台等关键控制点消毒结果检测，满足食品药品监督部门、卫生监督部门、食品加工行业、餐饮服务行业、航空配餐、大型企业食堂、学校食堂、大型活动保障部门等食品安全涉及领域细菌和环境物体表面检测。
ATP荧光检测仪通过荧光反应检测ATP，可以间接证明微生物的存在，快速检测医院环境物表、水质消毒效果是否达标。与常规培养检测法配合使用，可用ATP荧光检测法检测微生物污染，而用培养检测法鉴定微生物种类及污染源。
ATP荧光检测已成为目前医院感染环境卫生学监测中常用的手段，如今正大力推广这种便捷的检测方法，实现医院感染环境卫生学监测的简捷化和效率化。
ATP荧光检测仪的使用指导：
取样是影响准确性和一致性的关键之一，使用时可参照ATP荧光检测仪说明书采样、检测、计算得出结果并记录报告。一般来说采样分两种情况：
1、面积类：将ATP拭子采样棒一支在物体表面或双手指曲面从指跟到指端来回涂擦个两次（一只手涂擦面积约30cm2），并随之转动采样拭子。
2、体积类：将ATP拭子采样棒一支在待测液体充分浸湿。
ATP荧光检测仪取样后检测：将拭子放入手持ATP仪，获得被测样本与细菌污染程度相对应的ATP生物荧光值并判定卫生状况。
目前，常用的配套拭子有表面采样棒和水质采样棒，食品企业可以根据需要选用不同拭子进行采样。
